上海社会科学院国际问题研究所于2015年3月经上海市机构编制委员会批准，由汪道涵先生创立于1985年的上海市人民政府上海国际问题研究中心更名组建而成，原上海社会科学院国际关系研究所整建制并入，核定编制60人。合并更名之前，吴建民大使和上海市政协原副主席､上海社会科学院原党委书记兼院长王荣华教授曾担任上海国际问题研究中心主席。
上海社会科学院国际关系研究所于2011年9月经上海市机构编制委员会批准、由原上海社会科学院东欧中西亚研究所和亚洲太平洋研究所合并成立。作为国际关系研究所的前身，东欧中西亚研究所成立于1981年，亚洲太平洋研究所成立于1990年。上海社会科学院国际问题研究所现任所长王健，副所长刘阿明、王震。
作为国家高端智库上海社会科学院专门从事国际关系和全球问题研究的重要机构，国际问题研究所注重国际关系理论、国家外交战略和对外关系以及区域国别的相关研究，努力构建具有中国特色的国际关系理论体系，提升决策咨询和服务社会的功能，不断增强国际交流与合作水平。
国际问题研究所现有近50位专职研究人员，分设七个研究室（国际战略与中国外交研究室、东亚研究室、美洲研究室、欧洲研究室、俄罗斯中亚研究室、中东研究室、南亚印度洋研究室）、《国际关系研究》编辑部和行政办公室。另外，根据区域与国别研究的现实需要，结合长期形成的研究特色和未来增长点，目前设有一批相关研究中心。
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