国际关系学科专业点2002年设立于原亚洲太平洋研究所，2012年亚洲太平洋研究所、欧亚研究所与上海市国际问题研究中心合并为国际关系研究所，该专业点现为国际关系研究所主要学科。本学科主要研究领域为国际关系理论、大国关系与战略、地区国际关系（东亚、中亚、南亚、欧洲、中东、非洲、拉美等）、全球治理、国际体系改革、海洋安全、国际政治经济学等。本学科点的学术梯队由资深博士生导师、年富力强的硕士生导师与中青年科研人员组成。
目前这个学科拥有国家、上海市、各级部委办和海外委托各种课题；出版《国际关系研究》双月刊杂志；与世界经济研究所共同出版年度性的《国际地位报告》。与海内外著名智库有广泛的交流与学术合作。
经过10多年的不断地发展壮大，本学科已经出版了一系列的重要成果和形成了多个独具特色的研究领域，在国内外产生了重要的影响力。这些领域包括：
大国关系与战略研究：在中美、中日、中俄、中欧、中非关系、中国国家安全战略、美国东亚与中亚战略、俄罗斯安全战略研究方面，已经发表了一些对我国外交政策、学科建设有重要影响的专著、研究报告和论文。
海洋冲突与合作研究：重点是大国的海洋战略、东海与南海领土争端、海洋争议解决与危机管理、海上通道安全与海洋开发合作模式。目前已经形成4-5人的研究梯队，拥有国家、地方和部门多项课题，在政策咨询方面发挥着越来越大的作用。
地区冲突与合作研究：重点是中亚、东南亚、中东的民族、宗教、领土、边界、恐怖主义及伊斯兰极端势力等非传统安全及合作问题研究。有关专家已经在国内外一流学术期刊上发表大量学术性论文，其研究水平得到同行的高度认可；同时研究团队撰写的一些研究报告，获得了中央领导的重视。
地区组织研究：研究所所设的亚太经济合作组织（APEC）中心曾为2001年上海APEC领导人峰会作出了贡献。作为国内主要的中心之一，也是上海政府资助成立的专门研究机构，它已经同国际APEC联席会议和APEC秘书处建立了固定关系。上海合作组织研究中心是国家的主要研究基地，为上海合作组织峰会和各种合作项目提供了众多的政策咨询，为国家推动与俄罗斯和中亚国家的合作作出了卓越的贡献。
国际体系与理论研究：重点研究国际关系理论、全球治理理论、中国外交理论、国际机制和国家主权等问题，及中美在东亚地区的利益与竞争；两岸关系中的美国因素、中日关系、美日同盟作用等。
跨国界问题治理研究：重点研究包括：地区内的移民和难民、全球公地、环境、能源、流行病与气候问题合作等。其中，我所与国务院侨办、上海市侨联、统战部有课题合作，有关专著（《国家关系中的华侨华人和华族》）和论文曾获得上海社会科学一等、二等奖。
