朝鲜半岛问题研究。多年来，通过在一些知名学术期刊上发表大量学术性论文，其研究水平得到同行的高度认可；同时研究团队撰写的研究报告，部分获得了中央有关领导批示和新华社内参报道。朝鲜半岛研究中心在国内外已经确立了重要地位，海内外重要媒体经常就各种突发事件对中心负责人进行采访。
海洋冲突与合作研究。重点是大国的海洋战略、东海、南海领土争端、海界争议的合作模式。目前已经形成4-5人的研究梯队，拥有国家、地方和部门多项课题，在政策咨询方面发挥着越来越大的作用。
东南亚冲突与合作研究。重点是东南亚领土、边界、恐怖主义及伊斯兰极端势力等非传统威胁及合作问题研究。东南亚室是上海市唯一专门从事东南亚研究的分支机构，其中,APEC中心曾为2001年上海APEC领导人峰会作出了贡献。作为国内主要的中心之一，也是上海唯一的同类机构，已经同国际APEC联席会议和APEC秘书处建立了固定关系。
大国关系和国际体系研究。重点研究国际关系理论、国际机制和国家主权等问题，及中美在东亚地区的利益与竞争；两岸关系中的美国因素、中日关系、美日同盟作用等。主要突破性成果有专著：《国际体系：历史的演进与理论》、《国家主权新论》、《机制化生存》、《民族主义、国家结构与国际化》、《欧洲联盟集体身份的建构》》。这些成果对于中国国际关系理论具有探索、开拓和构建的作用。
地区跨国界问题治理研究。研究内容包括：地区内的移民和难民、环境、能源、流行病与气候问题合作等。其中，我所与国务院侨办、上海市侨联、统战部有委托课题合作，有关专著（《国家关系中的华侨华人和华族》）和论文曾获得上海社会科学一等、二等奖。
